第Ⅰ部　湖の科学
第1章　湖の世界
　●小宇宙から流域水循環へ
　●日本の湖沼学研究：黎明と展開
　●地球上の水と湖水の存在量
　●日本の湖の特色
　●地球環境変容のセンサーとしての湖　
第2章　湖の自然
　●湖盆の成因と形態
　●水収支
　●湖水の流動と循環
　●水色・透明度
　●水温
　●水質
　●湖底堆積物
　●生産と湖沼型

第Ⅱ部　日本の湖沼環境
第1章　北海道
　●サロマ湖――オホーツク海に面した広大な汽水湖
　●網走湖――深層に海水が侵入する二層構造をもつ
　●摩周湖――霧の中で神秘的な深い藍色の水をたたえる
　●屈斜路湖――御神渡り現象がみられる日本最大のカルデラ湖
　●阿寒湖――特別天然記念物マリモが生育
　●支笏湖――日本有数の水質のよさを誇る
　●倶多楽湖――ほぼ円形をした澄んだ湖
　●洞爺湖――周辺地域とともに世界ジオパークに認定
　●渡島大沼・小沼――秀麗な駒ヶ岳を望む風光明媚な湖
第2章　東北
　●十三湖――中世に栄えた幻の港町十三湊があった湖
　●十和田湖――観光とヒメマス養殖で知られる
　●一ノ目潟・二ノ目潟・三ノ目潟――周辺地層から地球深部の構成物質を発見
　●田沢湖――日本で最も深い湖
　●蔵王御釜――水色の変化が美しい強酸性の湖
　●裏磐梯湖沼群――磐梯山の噴火でできた多様な湖沼群
　●猪苗代湖――湖水がさまざまに利用される，水質のよい湖
第3章　関東
　●日光湯ノ湖――湯の香漂う山間の湖
　●中禅寺湖――日光国立公園の中の幽玄の湖
　●霞ヶ浦――日本で第2位の面積をもつ平地の湖
　●手賀沼――人口稠密地にあってさまざまな人的影響を受ける
　●榛名湖――多くの観光客が訪れる山上の湖
　●湯釜――緑白色の強酸性の湖
　●芦ノ湖――富士箱根伊豆国立公園に位置する景勝地
第4章　甲信越・東海・北陸
　●富士五湖――「富士山：信仰の対象と芸術の源泉」の一部としての世界遺産
　●野尻湖――ナウマンゾウ化石などの発掘で知られる
　●仁科三湖――北アルプスの麓に連なる静かな湖
　●諏訪湖――御神渡りの記録から過去の気候変動が復元
　●大正池――大正時代に誕生した新しい湖
　●高山湖沼群――さまざまな成因をもつ雲の上の湖沼群
　●浜名湖――古くからの東西交通の要所
　●三方五湖――湖沼環境の多様性と特異性で世界的に注目
第5章　近畿・中国・四国
　●琵琶湖――日本最大で世界第3位の古代型湖
　●中海――多様な産業を支える広大な汽水湖
　●宍道湖――神話と伝説の湖
第6章　九州
　●霧島湖沼群――火山の中に散らばる個性豊かな湖沼群
　●池田湖――山麓湧水を養う，深く明るい南国の湖
　●鰻池――火山地帯の静かな湖
　●上甑島湖沼群――海水との交流がもたらす南の島の不思議な湖沼群

●付表：日本のおもな湖の位置と湖盆形態／文献